江苏省脑区疾病临床医学中心依托南京脑科医院神经内科和神经外科建设,所属神经内科是国家临床重点专科、江苏省重点学科、江苏省临床重点专科、医学创新团队、中国研究型医院示范学科、国家脑卒中筛查与防控基地、中国神经系统遗传药理联盟示范实验室、江苏省神经疾病质控中心、江苏省卒中中心联盟副理事长单位、江苏省癫痫专科联盟主席单位、江苏省医学会神经病学分会主任委员和江苏省医师协会神经内科分会会长单位。神经外科为江苏省临床重点专科、江苏省神经外科质控中心挂靠单位、南京医科大学神经外科教研室所在单位,南京市重点专科等。2016年,南京脑科医院和首都医科大学附属北京天坛医院共建国家神经系统疾病临床医学研究中心江苏省分中心正式挂牌,中心设立神经干细胞与神经肿瘤、血管性神经病学2个研究和转化医学平台。作为中心依托科室神经内科和神经外科承担国家“863”计划,国家“973”计划,国家科技支撑计划、十二五科技攻关项目、国际合作重大项目、国家自然科学基金项目、江苏省自然科学基金项目、江苏省科技厅社会发展项目等国家级和省部级科研项目100余项,获得国际神经病学会Achibald C. McKeith青年研究奖、中国青年科技奖、吴阶平-保罗·杨森药学研究奖、教育部高校科技进步奖、中华医学科技奖、省部级和市级科技进步奖40余次。近五年,在The Lancet Neurology、Alzheimer's & Dementia 、Molecular Neurobiology、Human Brain Mapping、Clinical neurology、Stroke、Journal of Cerebral Blood Flow & Metabolism、Neurology、Journal of the Alzheimer's Disease、Journal of Neuroinflammation、Journal of Neurology、Sleep等重要神经科学杂志发表SCI收录论文200多篇,其中中科院JCR1区50余篇。