目前，距离地铁西二旗站最近的地铁站是八通线“果园”站（C口） 乘坐地铁到西二旗站的具体路线如下： 从“果园”站前往西二旗站的乘客，可乘坐 八通线 在“惠新西街南口”站换乘 10号线，最后抵达 “西二旗”站下车； 从“西二旗”站前往市区的乘客，可以乘 13号楼内换乘车 到达“五道口”站，然后选择 乘3号或4号线下车即可到达 北京地铁13号线西二旗站位于海淀区上地信息产业基地中心，是地下车站。13号线与2号线在立水桥枢纽进行换乘。 西二旗站由于地处北京高科技园区的核心地带，因此客流量相对较小些。
未来，地铁16号线将途径本小区并在西二旗设站，同时13A线和13B线也将通过该站进行换乘，届时西二旗站将成为一座三线换乘的地铁干线站点。
仰琛平优质答主西二旗站是北京地铁13号线和16号线的车站，位于中关村软件园区附近。“西二旗”一名来自附近的西二旗村，该村是昌平区回龙观镇下辖的城中村。北京地铁13号线西二旗站于2000年12月30日随该线一期工程通车时启用（原站名为“二厂”，2003年6月改名为现名），是13号线的东北端终点站和最高级站。北京地铁16号线西二旗站于2016年12月31日随该线北段（北安河站-西苑站）通车时启用。两线在本站平行换乘。
13号线站台为岛式站台，16号线站台为平行双岛式站台。13号线前往西二旗站的方向称为上行，相反方向称为下行；16号线往北安河站方向称为上行，往西苑站方向称为下行。
根据北京市交通委员会、北京市发展和改革委员会《关于北京轨道交通票价有关问题的通知》（京发改〔2014〕1511号），北京地铁13号线西二旗站和16号线西二旗站的计价单元均为0。
